Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TIMMDC1Q9NPL8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms