Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LIN28AQ9H9Z2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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