Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2J2Q9GZM3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms