Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CNTNAP3Q9BZ76 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CNTNAP3Q9BZ76 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CNTNAP3Q9BZ76 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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