Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC4A5Q9BY07 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms