Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EBF4Q9BQW3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EBF4Q9BQW3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms