Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA1CQ9BQE3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms