Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HOPXQ9BPY8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms