Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC7Q96M83 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms