Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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SAMD8Q96LT4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SAMD8Q96LT4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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