Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms