Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFHD2Q96C19 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms