Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKD1Q969G9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms