Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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GTF3C6Q969F1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GTF3C6Q969F1 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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