Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms