Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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ZNF439Q8NDP4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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