Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMER3Q8N944 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms