Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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