Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CCDC174Q6PII3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms