Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMPD1Q5SYB0 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms