Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PCID2Q5JVF3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms