Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HSP90AA4PQ58FG1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms