Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RAB6CQ53S08 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB6CQ53S08 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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