Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP36-203ENST00000370922 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RUNX1T1-227ENST00000520724 2103 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02473-201ENST00000569621 2195 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms