Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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RNF212Q495C1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF212Q495C1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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