Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TWISTNBQ3B726 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms