Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
IMPG1Q17R60 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IMPG1Q17R60 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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