Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PTPRNQ16849 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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