Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FXNQ16595 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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FXNQ16595 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FXNQ16595 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FXNQ16595 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FXNQ16595 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FXNQ16595 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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FXNQ16595 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FXNQ16595 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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