Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RBBP7Q16576 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms