Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNGA3Q16281 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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