Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PMCHL1Q16048 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PMCHL1Q16048 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PMCHL1Q16048 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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PMCHL1Q16048 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL1Q16048 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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