Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
TWIST1Q15672 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms