Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CYTH1Q15438 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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