Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SYCP1Q15431 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SYCP1Q15431 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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