Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCLAFQ15004 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms