Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NBR1Q14596 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NBR1Q14596 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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NBR1Q14596 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
NBR1Q14596 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NBR1Q14596 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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