Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RUNX3Q13761 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RUNX3Q13761 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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