Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CUL1Q13616 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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