Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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FOXE3Q13461 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
FOXE3Q13461 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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