Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NME3Q13232 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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NME3Q13232 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
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NME3Q13232 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME3Q13232 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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