Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms