Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LCP2Q13094 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LCP2Q13094 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms