Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK3Q13003 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK3Q13003 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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