Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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