Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FOXL1Q12952 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FOXL1Q12952 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms