Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
IFFO1Q0D2I5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IFFO1Q0D2I5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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