Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APLP2Q06481 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms