Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALD1Q05682 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms