Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PRKCDQ05655 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCDQ05655 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms